הוצאת תבונות פועלת במסגרת מכללת הרצוג, ומטרתה להוציא לאור פרסומים בתחום התורני-מדעי, בתחום העיוני ובתחום החינוכי. פרסומי ההוצאה עוסקים בתנ"ך, תורה שבעל פה, לימודי ארץ ישראל, הגות ומחשבה יהודית, לשון עברית וחינוך יהודי.
פרסומי ההוצאה רואים אור במסגרות מגוונות: כתבי עת, חומר לימודי המופק על ידי מרכז ההדרכה בתנ"ך שבמכללה, פרסומים של מורי המכללה, קובצי מאמרים וסיכומים של ימי העיון הנערכים במסגרת המכללה בנושאים העומדים על סדר יומנו.
הוצאת תבונות משמשת במה לחוקרים, לרבנים ולמורי המכללה, ומהווה מקור להפצת תכנים לימודיים מקוריים לתלמידים ולקהל הרחב.
כתבי העת שמוציאה המכללה הם:
מגדים- ביטאון לענייני מקרא
נטועים- ביטאון לתורה שבעל פה
על אתר- ביטאון לענייני ארץ ישראל במקורות
עד כה ראו אור במסגרת ההוצאה כ-50 ספרים, וכ-80 גיליונות של כתבי העת.