מסכת מקוואות הינה מסכת הלכתית, שלצערנו הרב אין עליה דיון מסודר בתלמוד הבבלי או בתלמוד הירושלמי. אמנם ישנם מדרשי הלכה, שמהווים יסודות לדיון, וכן הרבה סוגיות מפוזרות בש"ס ודיונים בראשונים ובגדולי האחרונים.
בדרך כלל נלמדת מסכת מקוואות בתוכניות הלכה, בגלל הצד המעשי של בנית מקוואות טהרה, ביחוד לטהר אישה לבעלה ולטבילת חסידות לגברים. ברם השיבה לארץ ישראל וחלק מההתכוננות לבניין הבית השלישי מחייבים אותנו להבין שעולם הטהרה שייך הן לגברים והן לנשים לא רק ביחס לחיי האישות אלא גם ביחס לכל כניסה למרחבי הקודש, ובעתיד גם ביחס לאכילה בטהרה של הקודשים ושל חולין הנאכלים על טהרת הקודש.
בשיעורים בישיבה עסקנו בלימוד ההלכות בעיון במקורות התנאים בראשונים ובגדולי האחרונים, ובהתבוננות בגדרי ההלכה לאור ניתוח היסודות הלמדנים.
מעבר לשאלות המעשיות, לימוד מקוואות בעיון הוא חלק מקניין תורה המוביל גם להבנה עמוקה בהיסק ההלכה למעשה. בירור יסודות הסוגיה נותן מבט חדש ושיקולים נוספים הן לפוסק ההלכה והן לכל אדם שרוצה לקיים את המצוות בקדושה ובטהרה.
